馮遠征1962年出生于北京市一個軍人家庭。1978年為了成為專業跳傘運動員，他放棄參加高考，結果“雞飛蛋打”。在工廠當臨時工時，業余參加文藝培訓班。1984年，馮遠征報考北京電影學院，因形象不行未被錄取。1985年考入北京人民藝術劇院，1989年應邀赴聯邦德國西柏林高等藝術學院戲劇系進修戲劇表演，主攻格羅托夫斯基表演學派。1991年回國，進入北京人民藝術劇院做演員。
1984年，馮遠征在報考北京電影學院表演系的考場上，被導演張暖昕選中，出演電影《青春祭》中的男主角任佳，開始了他的藝術生涯。1997年，與徐帆主演馮小剛執導的電視劇《月亮背面》；1998年，主演為紀念戊戌變法100周年而創作的電視劇《戊戌風云》，飾演光緒。1999年，參演李保田自導自演的電視劇《煙壺》，飾演“徐狗子”
2001年，參演《不要和陌生人說話》飾演暴力的安嘉和。2004年12月，在馮小剛的賀歲電影《天下無賊》中飾演娘娘腔劫匪。2005年，自導自演電視劇《滴血玫瑰》。
2006年，與殷桃、鄧超主演反映“無性婚姻”題材的電視劇《愛了散了》播出，反應家庭冷暴力的“無性婚姻”的話題成為大家關注的焦點。2007年，在電視劇《陽光普照大地》飾演20世紀70年代的工人。
2008年，在馮小剛電影《非誠勿擾》里飾演一個娘娘腔，提名第三十屆大眾電影百花獎最佳男配角。2009年，主演電視劇《偵探小說》，挑戰患有人格分裂癥的警長劉志文，劇中馮遠征不僅首次挑戰動作戲，還分飾父子兩角；參演電視劇《新人到中年》，扮演了一位“妻管嚴”。
2012年2月，與李玉剛、余少群主演電視《百花深處》，馮遠征在繼《不要和陌生人說話》之后，再次在電視劇中演繹變態角色，迷戀上了李玉剛飾演的男旦蕭俊生。
2011年1月，與陳寶國合作電視劇《鋼鐵年代》，出演煉鋼工程師，與陳寶國飾演一對“宿命冤家”。2012年，與閆妮合作電視劇《煮婦也瘋狂》。
2014年1月，主演愛情喜劇電視劇《男媒婆》，飾演喜感十足的土豪老板“潘高峰”。同年，參演電視劇《老農民》。
2015年4月，馮遠征受聘為南開大學的“校園文化大使”，并做客南開文化周末藝術沙龍，與現場500余名學生分享他的如戲人生。4月16日至25日與余少群主演的《風雪夜歸人》登陸國家大劇院。